Existen varias vías para la aplicación de las deducciones fiscales:

• Aplicación directa sobre el Impuesto de Sociedades
  
  Se efectúa al cierre del ejercicio y se recomienda documentar exhaustivamente el proyecto desde el punto de vista técnico, acorde con las definiciones vigentes, y desde el punto de vista económico detallando los gastos. Para esta vía, IASAF ha desarrollado su propia metodología de minimización del riesgo.

• A través de los instrumentos que el MICINN pone a disposición de las empresas para brindar seguridad jurídica, entre los que destaca la obtención de Informe Motivado
  
  Ofrece la seguridad jurídica necesaria puesto que es vinculante para la Agencia Tributaria, y da cuenta del cumplimiento de los requisitos con respecto a la naturaleza de las actividades del proyecto y en su caso, de los gastos imputados en el ejercicio para el que se solicita. Parte de la documentación a presentar la constituye el Informe Técnico de Certificación emitido por una entidad certificadora acreditada por ENAC, en el que se emite veredicto sobre las actividades que componen el proyecto y sus gastos asociados.
  
  Tipos de Informe Motivado relativos al cumplimiento de los requisitos científicos y tecnológicos:
  
  
  • Ex-ante
  • Contenido y Primera ejecución
  • Seguimiento